לאחר שעם ישראל עבר את הירדן להיכנס ארצה, המשכן הוקם בגלגל, שם עמד משך ארבע-עשרה שנות כיבוש וחלוקת הארץ. עם סיום חלוקת הארץ, המשכן עבר לשילה, שם הוא עמד 369 שנים. שלא כמו משכן המדבר והגלגל, משכן שילה היה מבנה אבן בלי גג, שנתכסה על ידי היריעות, המתוארות בפרשת תרומה.
תל שילה נחפר לראשונה לפני למעלה ממאה שנה, והחפירות חודשו ונמשכות. בקצהו הצפוני של התל, ישנו שטח חצוב בסלע הטבעי שמידותיו מתאימים למידות המשכן, ולכן יש להניח שזה היה מקומו של המשכן.
